{"doi":"10.14776/piv.2016.23.3.194","title":"Real-time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Using Total RNA Extracted from Nasopharyngeal Aspirates for Detection of Pneumococcal Carriage in Children","abstract":null,"journal":"Pediatric Infection and Vaccine","year":2016,"id":654121,"datarank":0.10397207708399181,"base_score":0.6931471805599453,"endowment":0.6931471805599453,"self_citation_contribution":0.10397207708399181,"citation_network_contribution":0.0,"self_endowment_contribution":0.10397207708399181,"citer_contribution":0.0,"corpus_percentile":null,"corpus_rank":null,"citation_count":1,"citer_count":0,"citers_with_citation_signal":0,"citers_with_endowment":0,"datacite_reuse_total":0,"is_dataset":false,"is_dataset_confidence":null,"is_data_producer":false,"deposit_databanks":null,"is_oa":false,"file_count":0,"downloads":0,"has_version_chain":false,"published_date":null,"fair_score":null,"fair_percentile":null,"algorithm_id":"datarank_citation_only_1hop_v6","ranking_scope":"data_only","authors":[{"id":1707085,"name":"Kyoung Hoon Lee","orcid":null,"position":1,"is_corresponding":false},{"id":1409305,"name":"Ki Wook Yun","orcid":"0000-0002-0798-6779","position":2,"is_corresponding":false},{"id":1437346,"name":"Mi Kyung Lee","orcid":"0000-0002-4347-6186","position":3,"is_corresponding":false},{"id":1707086,"name":"In Seok Lim","orcid":null,"position":4,"is_corresponding":false},{"id":1707084,"name":"Young Kwang Kim","orcid":null,"position":0,"is_corresponding":false}],"reference_count":0,"raw_metadata":{"has_enrichment":true,"resolved":true,"title":"Real-time Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction Using Total RNA Extracted from Nasopharyngeal Aspirates for Detection of Pneumococcal Carriage in Children","abstract":"목적: 폐렴구균은 주요 비인두 상재균으로, 주위 조직을 침범하여 침습성 감염을 일으킬 수 있어 보균 율에 대한 감시가 중요하다. 본 연구에서는 임상에서 비인두 흡인물로부터 추출하고 남은 RNA를 이용 하여 폐렴구균을 확인할 수 있는 실시간 중합효소 연쇄반응(real-time reverse transcription poly-merase chain reaction [RT-PCR])법을 구축하고, 보균율 측정에 있어서의 정확성과 이점을 확인하고자 하였다. 방법: 2014년 9월부터 10월까지 중앙대학교병원에 입원하여 호흡기 바이러스 RT-PCR 검사를 시행 받은 18세 이하의 소아들로부터 비인두 흡인물을 채취하였다. 먼저 배양법과 genomic DNA (gDNA) 를 이용한 real-time PCR을 시행하여 폐렴구균 검출률의 정확성을 확인하였다. 이 중 처음 20개의 검체 를 이용하여, 고전적인 배양법과 gDNA를 이용한 real-time PCR, 그리고 RNA를 이용한 real-time RT-PCR법을 시행하고 이를 비교 분석하였다. 결과: 총 157개의 검체에서 시행한 real-time PCR 검사는 기존의 배양검사와 일치율이 0.922 (P<0.01, Fisher exact test)로 매우 높았다. 배양검사에서 음성인 133개의 검체는 real-time PCR에서도 모두 음성을 보였다. 24개의 배양 양성 검체 중 21개의 검체는 real-time PCR에서도 양성이었지만, 나머지 검체는 음성 결과를 보였다. 20개의 검체에서 시행한 real-time RT-PCR 검사는 1개 검체를 제외 하고 배양법 및 real-time PCR과 결과가 일치하였다. 한편, 배양법을 시행하고 결과를 확인하기까지 는 총 26.5시간, real-time RT-PCR 검사에는 총 4.5시간이 소요되었다. 결론: 본 연구는 비인두 집락균 확인을 위한 real-time RT-PCR법의 확립과, 폐렴구균 보균율 측정에 있어서의 real-time RT-PCR 검사의 정확성 및 편의성을 보여주었다. Real-time RT-PCR 검사법 은 주요 세균들의 보균율 연구에 있어서 시간과 노력을 줄일 수 있는 좋은 방법이며, 폐렴구균의 역학 자료 수집에 큰 도움이 될 것으로 기대한다.","is_dataset_classified":null,"base_score":0.6931471805599453,"endowment":0.6931471805599453,"datacite_reuse_total":0,"file_count":0,"downloads":0,"views":0,"has_version_chain":false,"is_dataset":false,"is_oa":false,"pmid":"19162232","pmcid":null,"openalex_id":"https://openalex.org/W2598733973","authors":[],"funders":[],"total_grants":0,"fwci":0.0,"citation_percentile":0.20545588,"influential_citations":0,"citation_trend":[{"year":2022,"count":1}],"oa_status":"bronze","license":null,"oa_locations":[{"url":"http://synapse.koreamed.org/Synapse/Data/PDFData/1153PIV/piv-23-194.pdf","host_type":"journal"},{"url":"http://synapse.koreamed.org/Synapse/Data/PDFData/1153PIV/piv-23-194.pdf","host_type":"publisher"},{"url":"https://synapse.koreamed.org/pdf/10.14776/piv.2016.23.3.194","host_type":"publisher"},{"url":"https://synapse.koreamed.org/DOIx.php?id=10.14776/piv.2016.23.3.194","host_type":"publisher"},{"url":"https://piv.or.kr/Synapse/Data/PDFData/1153PIV/piv-23-194.pdf","host_type":"publisher"},{"url":"https://doi.org/10.14776/piv.2016.23.3.194","host_type":"journal"}],"fields_of_study":["Respiratory viral infections research","Pneumonia and Respiratory Infections","Viral gastroenteritis research and epidemiology"],"mesh_terms":[],"keywords":["Medicine","Reverse transcription polymerase chain reaction","Reverse transcriptase","Polymerase chain reaction","Carriage","Real-time polymerase chain reaction","Virology","Immunology","Pathology","Messenger RNA","Gene","Biology","Genetics"],"sdg_mappings":[],"linked_datasets":[],"clinical_trials":[],"software_tools":[],"database_accessions":[],"source":"live","citation_network_status":"fetched"},"created_at":"2026-08-11T03:56:42.405750Z","pmid":null,"pmcid":null,"fwci":null,"citation_percentile":null,"influential_citations":0,"oa_status":null,"license":null,"views":0,"total_file_size_bytes":0,"version_count":0,"fair_f":null,"fair_a":null,"fair_i":null,"fair_r":null,"fair_zscore":null,"fair_rationale":null,"fair_model":null,"fair_agent_version":null,"fair_fulltext_source":null,"fair_has_llm":null,"fair_computed_at":null,"clinical_trials":[],"software_tools":[],"db_accessions":[],"linked_datasets":[],"topics":[]}